果树学报

2021, v.38(09) 1569-1578

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沃柑果皮响应柑橘锈螨危害的转录组分析
Transcriptome analysis of citrus rustmite damage to the peel of Orah fruits

田帅;邱发发;葛聪聪;黄桂香;王国全;

摘要(Abstract):

【目的】揭示柑橘抗柑橘锈螨危害的分子机制,筛选出在柑橘锈螨危害条件下的相关应答基因。【方法】研究以接种柑橘锈螨后危害3、5、7、9 d的沃柑果实为试材,健康果实为对照(CK),采用Novaseq6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析。【结果】共获得了55.63 Gb clean bases,去除低质量碱基和接头序列后,CK3、CK5、CK7和CK9获得Clean reads分别是42 115 939、45 501 683、58 118 008和40 715 511条,WG3d、WG5d、WG7d和WG9d获得Clean reads分别是46 807 089、49 185 798、44 437 798和44 035 730条。柑橘锈螨危害3、5、7、9 d后引起上调差异表达基因数量分别为2764、1812、3217、2778个,下调差异表达基因数量分别为3036、1387、3350、2347个。GO功能富集分析结果显示,差异表达基因在不同的柑橘锈螨危害时间段,主要集中在生物学过程、细胞组分和分子功能中。KEGG注释分析结果显示,差异表达基因主要参与二苯乙烯、二芳基庚烷和姜辣素的生物合成、核糖体、磷酸戊糖、光合作用、碳代谢等途径。【结论】植物激素信号转导、植物病原互作通路、类黄酮生物合成、苯丙氨酸代谢、戊糖磷酸代谢5条通路在沃柑响应柑橘锈螨胁迫过程中起到了重要的调控作用。

关键词(KeyWords): 沃柑;柑橘锈螨;转录组;差异表达基因

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家重点研发计划支持项目(2018YFD0201500);; 广西科技重大专项(桂科AA17204026);; 广西现代农业产业技术体系柑橘创新团队(nycytxgxcxtd-05-08)

作者(Author): 田帅;邱发发;葛聪聪;黄桂香;王国全;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20200590

参考文献(References):

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