果树学报

2012, v.29(02) 177-183

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无核白葡萄脱水素等位基因的克隆及序列分析
DNA sequencing of alleles of DHN1 in Vitis vinifera cv.Thompson Seedless and their bioinformatics analysis

吴康;杨亚州;张朝红;张剑侠;郭翠英;王跃进;

摘要(Abstract):

以欧洲葡萄无核白品种(Vitis vinifera cv.Thompson Seedless)为研究材料,根据霞多丽品种脱水素基因序列设计引物并PCR扩增。PCR产物用地高辛标记并Southern杂交分析,发现无核白基因组含有2个不同的脱水素基因。设计并采用一种基于对琼脂糖凝胶梯状切割回收的方法克隆这2个不同脱水素基因的DNA片段,分别命名为DHN1-L和DHN1-S。进一步用反向PCR法获得这2个脱水素基因DNA片段的侧翼序列,获得基因DNA全长序列(NCBI登录号分别为EF371882和EF371881)。与已公布葡萄基因组序列比对,这2个基因位于第4号染色体相同位置,为等位基因,说明无核白品种脱水素基因为杂合体。2个脱水素基因所翻译蛋白在疏水性及三级结构方面有差异。无核白葡萄脱水素基因等位基因DNA序列的获得为进一步分析等位基因变异对植物抗逆性的影响提供了依据。

关键词(KeyWords): 无核白葡萄;脱水素基因;等位基因;克隆;序列分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 现代农业产业技术体系专项资金资助(CARS-30-yz-7);; 公益性行业(农业)科研专项经费(200903044)

作者(Author): 吴康;杨亚州;张朝红;张剑侠;郭翠英;王跃进;

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