果树学报

2020, v.37(04) 485-494

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石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析
Identification of SUT genes and their expression models during the development of seed in pomegranate

骆翔;曹尚银;李好先;赵弟广;张富红;陈丽娜;Krishna Poudel;敬丹;唐丽颖;

摘要(Abstract):

【目的】对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考。【方法】利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系。【结果】共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关;石榴SUT基因启动子区含有10种MYB元件;此外,4个石榴SUT基因(PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL0145770.1)在籽粒发育过程中发生了差异表达。【结论】SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关。

关键词(KeyWords): 石榴;SUT;基因家族;籽粒;表达分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(31901343);; 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2016-ZFRI-03)

作者(Author): 骆翔;曹尚银;李好先;赵弟广;张富红;陈丽娜;Krishna Poudel;敬丹;唐丽颖;

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