果树学报

2019, v.36(12) 1619-1629

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甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析
Identification of new polymorphic SSRs, fingerprinting and cluster analysis in sweet cherry

王晶;张开春;张晓明;闫国华;周宇;段续伟;陈玲;

摘要(Abstract):

【目的】应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求,储备一批新多态性SSR,并获得其在甜樱桃品种中的基因型数据。【方法】从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中,根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个SSR。用ABI3730,鉴定出其中9个SSR在4个代表甜樱桃品种中具有多态性。另外从305个李属SSR中又鉴定出9个多态性SSR。用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株,然后用多态性信息比价高的11个SSR(其中包括8个新SSR)和S基因标记,构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库,并获得了可以区分48个品种的最少标记组合。【结果】聚类分析表明,48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组。聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证。【结论】鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型,验证了一种可以有效获得多态性SSR的途径,提供了9个新的多态性SSR及其等位基因大小,用12个分子标记构建了48个甜樱桃品种指纹图谱。本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠。

关键词(KeyWords): 甜樱桃;SSR;指纹图谱;S基因型

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 北京市农林科学院协同创新专项(KJCX201910);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20161504、KJCX20170111);; 国家自然科学基金(31601726)

作者(Author): 王晶;张开春;张晓明;闫国华;周宇;段续伟;陈玲;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190134

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