果树学报

2011, v.28(06) 1111-1116

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猕猴桃EST-SSR引物筛选及通用性分析
Mining and transferability analysis of EST-SSR primers in Kiwifruit(Actinidia spp.)

廖娇;黄春辉;辜青青;曲雪艳;徐小彪;

摘要(Abstract):

应用SSRHunter软件对NCBI公共数据库中的猕猴桃EST序列进行筛查,利用Primer 5.0软件设计引物并进行筛选,同时对其在部分柑橘类植物的通用性进行分析。以漓江猕猴桃DNA为模板,对所设计的97对EST-SSR引物进行筛选,结果表明其中77对引物能扩增出清晰条带,有效扩增率为79.38%。随机选取20对引物对10份猕猴桃资源进行检测,结果发现有17对引物对所有材料都有扩增产物并呈现出多态性,多态性扩增率为85%。随机应用20对有效EST-SSR引物对兴津、金柑、枳壳、椪柑、酸柚、甜橙、胡柚、尾张、宫川等柑橘类植物基因组DNA进行扩增,结果表明,其中有11对引物在供试材料中有扩增产物,占引物总数的55%;有8对引物的扩增产物具有多态性,扩增率为72.7%。据此,基于猕猴桃EST序列而筛选的SSR引物在柑橘类植物中具有一定的通用性。

关键词(KeyWords): 猕猴桃;EST-SSR;引物筛选;柑橘;通用性

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(No.30660113,30860167)

作者(Author): 廖娇;黄春辉;辜青青;曲雪艳;徐小彪;

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DOI:

参考文献(References):

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