果树学报

2020, v.37(11) 1623-1635

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菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析
Genome-wide identification of pineapple TCP gene family and analysis of expression profile in flower induction stage

阮城城;胡福初;罗志文;王祥和;郭利军;李玉静;范鸿雁;韩冰;陈哲;张治礼;

摘要(Abstract):

【目的】筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考。【方法】以‘台农16号’菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRTPCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况。【结果】共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族。菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5~AcTCP9均含有乙烯响应元件。表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍。【结论】鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关。

关键词(KeyWords): 菠萝;TCP基因;基因家族;表达分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(31960589);; 海南省科协青年科技英才学术创新计划(QCXM201803);; 海南省属科研院所技术开发专项(KYYS-2018-02)

作者(Author): 阮城城;胡福初;罗志文;王祥和;郭利军;李玉静;范鸿雁;韩冰;陈哲;张治礼;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20200165

参考文献(References):

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