果树学报

2006, (06) 903-906

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简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆
Programming design of degenerate primers and the cloning of litchi HMGR gene fragments

夏瑞;陆旺金;李建国;杜娟;

摘要(Abstract):

主要介绍了利用NCBI、DDBJ、Blockmaker、CodeHop和Oligo6.0等数据库和生物软件进行简并引物设计的方法。利用设计的6对简并引物进行RT-PCR,从荔枝(LitchichinensisSonn.)果实中克隆到2个长度分别为510bp和582bp的cDNA片段。通过Blastx检索Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的HMGR基因具有较高的氨基酸序列同源性。研究表明,该程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高,能迅速得到满意结果。

关键词(KeyWords): 荔枝;间并引物;程序化设计;HMGR基因;克隆

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(30370995)。

作者(Author): 夏瑞;陆旺金;李建国;杜娟;

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