果树学报

2015, v.32(03) 404-412+521

[打印本页] [关闭]
本期目录(Current Issue) | 过刊浏览(Past Issue) | 高级检索(Advanced Search)

基于RNA-seq的黄肉猕猴桃类胡萝卜素合成相关基因的表达分析
Analysis of expression of the related genes with carotenoids synthesis in yellow flesh kiwifruit(Actinidia chinensis)based on RNA-seq

张晓慧;黄春辉;钟敏;陈楚佳;郎彬彬;曲雪艳;徐小彪;

摘要(Abstract):

【目的】探讨黄肉猕猴桃发育过程中果实类胡萝卜素合成途径中相关差异基因的功能。【方法】以黄肉型中华猕猴桃‘金丰’果实为试材,在前期RNA-seq测序的基础上,利用实时荧光定量PCR技术检测其类胡萝卜素合成过程中相关差异基因的表达水平。【结果】Unigene23885、CL10798、Unigene11266、CL1511四个基因相对表达量较高,其他基因表达量相对较低;相关性分析结果显示,类胡萝卜素含量与Unigene11266、Unigene23885、Unigene2673三个基因相对表达量显著相关,与基因Unigene23823、Unigene12775相对表达量呈极显著相关。聚类分析结果显示,基因Unigene23885和Unigene11266、基因CL1511和CL10798分别被聚为一类,其表达模式非常接近且与其他基因明显不同,并在类胡萝卜素合成中高水平表达,基因CL10467与其距离最近。【结论】综合相关性分析和聚类分析,基因Unigene11266、Unigene23885可能是类胡萝卜素合成的关键基因,且较其他基因而言,基因CL10467、Unigene12775、CL10798、CL1511、Unigene2673与其关系更密切。

关键词(KeyWords): 黄肉猕猴桃;类胡萝卜素;转录组测序;相关差异基因;相对表达量

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(31160385);; 江西省自然科学基金(20122BAB214023);; 江西省科技支撑计划(20121BBF60022)

作者(Author): 张晓慧;黄春辉;钟敏;陈楚佳;郎彬彬;曲雪艳;徐小彪;

Email:

DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20140485

参考文献(References):

扩展功能
本文信息
服务与反馈
本文关键词相关文章
本文作者相关文章
中国知网
分享