果树学报

2021, v.38(11) 1854-1867

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基于SSR标记的中亚生态区核桃(Juglans regia L.)遗传多样性与种群结构分析
Analysis of genetic diversity and population structure of walnut(Juglans regia L.) in Central Asia ecological region based on SSR markers

马凯;赵钰;张恒;韩立群;赵国庆;王继勋;

摘要(Abstract):

【目的】从分子水平探究中国新疆与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦2个中亚国家共6个区域核桃种质资源间的遗传多样性及亲缘关系。【方法】采用SSR分子标记方法对采自6个区域的137份核桃种质资源进行遗传多样性和居群遗传结构分析。【结果】利用14对引物共检测到130个等位变异位点,变异范围为6~13,平均每对SSR引物可检测到9.285 7个等位位点;14个SSR位点的占比范围为0.625 7~0.865 1,平均值0.763 4;平均Shannon’s多样性指数(I)为0.459 8;种群总基因多样性(Ht)平均值为3.248 1;种群内基因多样性(Hs)平均值为2.108 9;种群间的遗传分化指数(Gst)范围为0.057 8~0.406 8,平均值为0.259 5;基因流(Nm)平均值为3.017 4;各个等位基因频率整体分布不均匀。UPGMA聚类结果显示,137份供试材料在遗传相似性系数为0.75时分成3个类群。其中,第一类群共42份,包括中国新疆阿克苏地区16份,中国新疆和田地区21份,吉尔吉斯斯坦5份;第二类群共44份,包括中国新疆伊犁地区12份、吉尔吉斯斯坦32份;第三类群共51份,包括中国新疆喀什地区19份、塔吉克斯坦13份和中国新疆伊犁地区19份。聚类结果在一定程度上表明了居群间亲缘关系的距离,总体分布与地理分布有关,不同区域之间存在一定的基因交换。聚类结果与居群间遗传距离和遗传一致度结果一致。【结论】SSR分子标记结果表明,中亚生态区不同地理分布的核桃种质资源遗传多样性存在差异,为揭示中亚生态区核桃种群结构及传播途径提供了依据。

关键词(KeyWords): 核桃;种质资源;SSR;遗传多样性;遗传结构

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 新疆维吾尔自治区天山青年计划(2020Q031);; 新疆维吾尔自治区资源共享平台建设项目(PT2027);; 新疆维吾尔自治区区域协同创新专项(上海合作组织科技伙伴计划及国际科技合作计划)(2018E01001)

作者(Author): 马凯;赵钰;张恒;韩立群;赵国庆;王继勋;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20210223

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