果树学报

2015, v.32(06) 1020-1027+1314

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‘库尔勒香梨’脱萼组与宿萼组样品差异表达基因的筛选
Screening of differentially expressed genes in‘Korla fragrant pear'flower samples with persistent or deciduous calyx

孙晓霞;牛建新;王博慧;裴茂松;李陈静;曹福军;

摘要(Abstract):

【目的】系统研究‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组花器官的转录组表达情况,筛选2者之间的差异表达基因,为进一步阐明‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组代表样品进行测序,利用生物信息学方法筛选2者的差异表达基因和进行功能基因预测。【结果】Trinity法拼接后得到48 894条unigenes序列,从中选取了2组样品中共表达和单独表达的SPL转录因子进行了功能探究,发现3条unigenes可能与萼片发育有关。筛选的差异表达基因获得了Gene Ontology和KEGG数据库的注释,涉及植物激素信号转导、光合代谢、苯丙氨酸代谢、芳香族化合物合成、细胞发育等与萼片发育相关过程。【结论】筛出了2组样品的差异表达基因,获得了与萼片发育相关的基因及其对应的功能注释,为今后进一步研究‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定了良好基础。

关键词(KeyWords): ‘库尔勒香梨’;萼片;转录组测序;差异表达分析;基因功能注释

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金资助项目(30360066);; 国家科技攻关计划引导项目(2003BA546C);; 兵团科技攻关计划项目(2011BA003-3);; 兵团科技创新团队建设项目(2013CC002)

作者(Author): 孙晓霞;牛建新;王博慧;裴茂松;李陈静;曹福军;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20140393

参考文献(References):

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