果树学报

2010, v.27(04) 551-555

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菠萝基因组SSR分子标记的开发
Development of molecular markers from genomic-SSR of Pineapple (Ananas comosus)

童和林;冯素萍;陈友;陈业渊;孙光明;武耀廷;

摘要(Abstract):

实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点,其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个。二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GA/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39/91)。研究未发现三核苷酸及以上的重复单元。36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记。

关键词(KeyWords): 菠萝;基因组SSR标记;开发;验证

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家科技基础条件平台重点项目(2005DKA21000-5-43)

作者(Author): 童和林;冯素萍;陈友;陈业渊;孙光明;武耀廷;

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DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.2010.04.015

参考文献(References):

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